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マルチオミックスサイトメトリー
遺伝子発現データと数百種のタンパク質データを組み合わせることで、細胞の表現型をさらに詳細に決定します。
完全な免疫レパトア
アイソタイプを含むIgおよびT細胞受容体α/βの完全長ペア配列
免疫マッピング
免疫レパトアと抗原特異性をシングルセルの分解能で組み合わせ
データ解析
強力かつ直感的なソフトウェアでクロノタイプの情報を探索し、視覚化
ラボ作業は1日
わずか1日でサンプルからシーケンス可能なライブラリーを作製
スケール対応可能なソリューション
数百から数万の細胞に対するスループット能力を備えた、研究に適したキットを用意
GEM-X の利点
感度、スループット、データ品質、サンプル回収率の向上
GEM-Xテクノロジーは次世代のChromiumアッセイを推進し、現在および将来の強力なシングルセル研究の基盤となります。改良されたマイクロ流路、アッセイ試薬、ソフトウェアのアップデートはすべて連携して働き、得られる知見を最大化します。
最大2倍の遺伝子を検出
以前のバージョンと比較して感度が大幅に向上
スループットが2倍に拡大
より低コストでより高いスループットなスケールのために
マルチプレット率を1/2に低減
一定数の細胞に対して少ない倍数でデータ品質を向上
最大80%の細胞捕捉効率
サンプル回収率の向上により、すべての測定を最大限に活用
目的に応じたソリューションの数々
包括的な免疫プロファイリングのためのシングルセル解像度
マルチオミックス解析
細胞表面タンパク質の発現と抗原特異性を5'遺伝子発現と同時に測定します。
免疫レパトアプロファイル
B細胞やT細胞の受容体の全長配列をシングルセルレベルで捉えることで、クローンの拡大や多様性を理解します。
- ペアになった受容体の配列から、抗原結合や機能を調査
- 遺伝子発現データと組み合わせることで、免疫細胞の分類を行い、新しい細胞の状態を探索
細胞表面タンパク質
シングルセルレベルでの遺伝子発現測定と免疫フェノタイピングを相関させることで、免疫細胞のサブセットや機能状態をより明確にします。
- マルチオミックスサイトメトリーを用いて、数百種類ものタンパク質を同時に検出。バイアスのない遺伝子発現プロファイリングを行うことで、超高パラメーターでの探索が可能
- 同じ細胞内でタンパク質のアイソフォームと制御ネットワークの共発現を相関させることで、免疫細胞集団を層別化
Barcode Enabled Antigen Mapping (Next GEM)
抗原特異的な細胞プロファイル(シングルセルからの完全長ペアV(D)J配列、遺伝子発現、細胞表面タンパク質を含む)を包括的に取得し、治療法の発見を加速するために、希少な抗原反応性T細胞およびB細胞を同定します。
- シングルセルから全長、対になったV(D)J配列、遺伝子発現、表面タンパク質発現から抗原特異的なクローン型を発見
- サンプル採取から抗原特異的免疫レパトアのシーケンスデータ取得まで1週間で完了
- 使いやすい解析・視覚化ソフトウェアで抗原とクローン型の関係を探索・解釈
CRISPR スクリーン
細胞のsgRNAを直接キャプチャーし、遺伝子発現や細胞表面タンパク質などの表現型を変化させることで、CRISPRによる摂動の影響を単一細胞の分解能で評価します。
- 疾患に関与する新規遺伝子ターゲットや耐性ドライバーのスクリーニング
- より迅速なワークフローと高解像度で機能的遺伝子スクリーニングの強化す
- 発生に関与する複雑な遺伝子制御パスウェイの解明
大規模プロジェクト
ハイスループット(HT)キットと大規模プロジェクト用のソリューションにより、希少な細胞型の発見からトランスレーショナルリサーチまで、最も意欲的なプロジェクトに取り組むことが可能です。
シングルセル免疫プロファイリング HT (Next GEM)
新しいChromium Xでは、シングルセル免疫プロファイリングにハイスループット(HT)マルチオミクス解析を導入し、適応免疫系の驚くべき多様性を明らかにできます。
- 結果までの時間を大幅に短縮
1つのチップで最大16サンプル、数十万個のシングルセルを同時解析
- スケールメリットを享受
ハイスループット機能を活用し、ターゲット遺伝子発現により、実験や解析のコストをさらに削減
- 事前準備から解析までサポート
技術的なリソースから、ユーザーフレンドリーなクラウドベースのデータ解析(米国のみ)まで、エンドツーエンドでのサポート
ワークフロー自動化
Chromium Connectのシングルセル免疫プロファイリングを使うと、ラボの生産性を最大化し、安定した再現性のある結果を得ることが可能
自動化されたシングルセル免疫プロファイリング (Next GEM)
Chromium Connectで免疫プロファイリングのワークフローを自動化。T細胞やB細胞のレパトア多様性探索、希少な細胞集団の特定、疾患や治療に応じたクローン増大を明らかにし、生産性を向上させる
- 生産性の向上
シングルセルからシーケンス用のライブラリー作製までを自動化。ハンズオンタイムを短縮し、免疫プロファイリングの利便性を実現
- ワークフローを標準化
実験、ユーザー、さらには複数のサイトにまたがり安定して再現性のあるシングルセル免疫プロファイリング結果を生成
- オペレーションの効率化
自動化専用試薬を使用し、カラーコードと2Dバーコードによって試薬のトラッキングやローディングを確実に実行
実績のある結果
論文
Combined PD-1, BRAF and MEK inhibition in BRAFV600E colorectal cancer: a phase 2 trial
Combined PD-1, BRAF and MEK inhibition in BRAFV600E colorectal cancer: a phase 2 trial
Jun Tian, et al. Nature Medicine (2023).
Jun Tian, et al. Nature Medicine (2023).
Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens
Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens
Francesco Maura, et al. Nature Cancer (2023).
Francesco Maura, et al. Nature Cancer (2023).
Transcriptional signatures associated with persisting CD19 CAR-T cells in children with leukemia
Transcriptional signatures associated with persisting CD19 CAR-T cells in children with leukemia
Nathaniel Anderson, et al. Nature Medicine (2023).
Nathaniel Anderson, et al. Nature Medicine (2023).
関連資料
Chromiumシングルセル免疫プロファイリングの最新アプリケーションノートや製品資料をご覧ください。
A New Way of Exploring Immunity—Linking Highly Multiplexed Antigen Recognition to Immune Repertoire and Phenotype
A New Way of Exploring Immunity—Linking Highly Multiplexed Antigen Recognition to Immune Repertoire and Phenotype
Application Note, 10x Genomics
Application Note, 10x Genomics
Improving Single Cell Characterization with Simultaneous Gene Expression and Cell Surface Protein Measurements at Scale
Improving Single Cell Characterization with Simultaneous Gene Expression and Cell Surface Protein Measurements at Scale
Application Note, 10x Genomics
Application Note, 10x Genomics
The neXt generation of single cell starts with GEM-X
The neXt generation of single cell starts with GEM-X
GEM-X Single Cell Flyer, 10x Genomics
GEM-X Single Cell Flyer, 10x Genomics
エンドツーエンドのソリューション
Next GEM技術を用いたChromium装置
拡張可能な装置
Chromium シングルセル免疫プロファイリング試薬
5' mRNA、完全長対のBCRおよびTCR配列、抗原受容体特異性、細胞表面タンパク質などを含む多次元的アプローチで適応免疫を探索できる試薬キット
グローバルな技術・カスタマーサポート
専門サポートチームがメールと電話で対応
よくある質問
このソリューションは複数のデータタイプをひとつのシングルセルから同時検出して統合解析をできます。これにはmRNAベースの全トランスクリプトームあるいはターゲット遺伝子発現、免疫フェノタイピング、適応免疫レパトアのクローン性と多様性、抗原特異性を含みます。細胞を特徴づけるマルチオミックスアプローチにより、免疫システムを細胞ごとに理解できます。
はい。免疫グロブリンまたは TCRのライブラリーのみを増幅しシーケンスできます。増幅された全トランスクリプトーム cDNAは、保存しておけば後でシーケンスすることもできます。
Chromiumシングルセル免疫プロファイリングは、新鮮または凍結保存されたシングルセル懸濁液と互換性があります。代表的なサンプルには、PBMCs、腫瘍浸潤リンパ球、脾臓、骨髄細胞、その他の組織タイプが含まれます。種は、ヒト、マウス、ラット、および他のモデル生物から選択することができます。なお、免疫グロブリンまたはTCRシーケンスについては、現在10x Genomics試薬とプロトコールでサポートされているのはヒトとマウスのみです。
Chromiumシンブルセル免疫プロファイリングソリューションは、IgおよびTCR遺伝子の不変領域に遺伝子特異的増幅プライマーが設計されていています。これにより、可変領域、多様性領域、および結合遺伝子セグメントにわたる配列を濃縮し、シーケンスします。
はい、免疫グロブリン重鎖配列は、IgA、IgD、IgE、IgM、およびIgGによって分類されます。
Next GEMとGEM-Xチップはいずれも、Chromiumのワークフローの一環としてエマルジョン中のゲルビーズ(GEM)を効率的に生成します。しかし、GEM-Xチップにはより高いパフォーマンスを発揮する新技術が使用されており、基本設計、設定および細胞分画サイズはすべて、Next GEMおよびこれまでのアッセイから得られた豊富な経験に基づいて最適化されています。GEM-Xチップは、10xの全範囲のChromiumアッセイをサポートするChromium XおよびiX機器でのみ使用できます。