超高参数
通过测定数百个细胞表面表位的丰度来扩展蛋白质组学探索。
单细胞多组学
同时分析mRNA和细胞表面蛋白，以及TCR/Ig序列和抗原特异性。
无缝的工作流程
与流式细胞术的染色步骤相似，不存在光谱重叠或参数限制。
快速的周转时间
从细胞染色到立即可测序的文库，整个过程最快只需一天。
简化的数据分析
通过易用的软件来探索和查看多种类型的数据。
兼容不同的样本
经验证适用于PBMC、新鲜和冷冻的细胞系以及解离的组织。
探索您的应用
对复杂的细胞亚型进行分型
发现新的细胞类型和功能
发现新的生物标志物
筛选抗原特异性的T细胞
久经考验的结果
视频
文献
A pan-cancer blueprint of the heterogeneous tumor microenvironment revealed by single-cell profiling
A pan-cancer blueprint of the heterogeneous tumor microenvironment revealed by single-cell profiling
Cell Research. Junbin Qian et al., 2020.
Cell Research. Junbin Qian et al., 2020.
Broad immune activation underlies shared set point signatures for vaccine responsiveness in healthy individuals and disease activity in patients with lupus
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Nature Medicine. Yuri Kotliarov et al., 2020.
Nature Medicine. Yuri Kotliarov et al., 2020.
Single-cell multiomic analysis identifies regulatory programs in mixed-phenotype acute leukemia
Single-cell multiomic analysis identifies regulatory programs in mixed-phenotype acute leukemia
Nature Biotechnology. Jeffrey M Granja et al., 2019
Nature Biotechnology. Jeffrey M Granja et al., 2019
资源
Improving Single Cell Characterization with Simultaneous Gene Expression and Cell Surface Protein Measurements at Scale
Improving Single Cell Characterization with Simultaneous Gene Expression and Cell Surface Protein Measurements at Scale
Application Note, 10x Genomics
Application Note, 10x Genomics
Characterization of the Tumor Microenvironment
Characterization of the Tumor Microenvironment
Application Note, 10x Genomics
Application Note, 10x Genomics
完整的解决方案
Chromium单细胞试剂
使用我们的试剂盒，您可以获得单细胞的多维度全面视图，包括mRNA、细胞表面蛋白、全长配对的BCR和TCR序列，以及抗原-受体特异性。
世界级的技术支持和客户支持
您可以通过电话或电子邮件联系我们的专家支持团队。
必需的组件
单细胞免疫分析
- Chromium Next GEM Single Cell 5′ Library and Gel Bead Kit v2 (1000265, 4 rxns | 1000263, 16 rxns)
- Chromium Next GEM Single Cell 5’ HT Kit v2 (1000374, 8 rxns | 1000356, 48 rxns)
- Chromium 5′ Feature Barcode Kit (1000256, 16 rxns)
- Chromium Next GEM Chip K Single Cell Kit (1000287, 16 rxns | 1000286, 48 rxns)
- Dual Index Kit TN Set A (1000250, 96 rxns – Protein Libraries)
- Dual Index Kit TT Set A (1000215, 96 rxns – Gene Expression Libraries)
- Targeted Gene Expression
- 10x Compatible BioLegend Total-Seq™–C antibodies
- 10x Compatible BioLegend TotalSeq™–C Human Universal Cocktail, V1.0
- 10x Compatible Abcam 5’ Feature Barcode Antibody Conjugation Kit - Lightning-Link®
单细胞基因表达
- Chromium Next GEM Single Cell 3' Kit v3.1 (1000269, 4 rxns | 1000268, 16 rxns)
- Chromium Next GEM Single Cell 3’ HT Kit v3.1 (1000370, 8 rxns | 1000348, 48 rxns)
- Chromium 3’ Feature Barcode Kit (1000276, 16 rxns)
- Chromium Next GEM Chip G Single Cell Kit (1000127, 16rxns | 1000120, 48 rxns)
- Dual Index Kit NT Set A (1000242, 96 rxns – Protein Libraries)
- Dual Index Kit TT Set A (1000215, 96 rxns – Gene Expression Libraries)
- Targeted Gene Expression
- 10x Compatible BioLegend TotalSeq™–B antibodies
工作流程
- 1
制备您的样本
通过与独特的寡核苷酸条形码偶联的TotalSeq™–B/C抗体来标记细胞。与此同时，您也可以通过流式抗体染色来富集感兴趣的细胞群。细胞经过洗涤，接着进行10x文库的构建。
资源 - 2
构建10x文库
采用我们的试剂盒和兼容的Chromium仪器构建带有条形码的10x文库。Chromium仪器家族的任一平台将每个细胞和一个带有10x条形码的凝胶珠封装在单个液滴中。在每个纳升级的液滴中，mRNA和细胞表面蛋白对应的转录本都经过逆转录生成cDNA，其中单个细胞的所有cDNA都带有共同的10x条形码。
资源 - 3
- 4
数据分析
Cell Ranger将原始的测序数据转化成有生物学意义的见解。Cell Ranger可处理基因表达和细胞表面蛋白文库的数据。
分析流程输出
输出结果包括质控信息和文件，这些文件可轻松用于Loupe Browser可视化软件或第三方工具的进一步分析。
资源 - 5
数据可视化
使用我们的Loupe Browser，您可以根据基因表达和细胞表面蛋白来定义和比较细胞类型。
只有生物信息学家才能使用吗？
Loupe是点选式软件，任何人都可以轻松下载和使用。
资源
常见问题
在流式细胞分析中，由于固有的光谱重叠，可测定的蛋白数量受到限制，但Feature Barcode技术能够测定数百个参数，而无需进行荧光补偿。我们比较了分别从流式细胞术和Feature Barcode信号中获得的荧光强度和UMI计数的分布。结果表明，两种技术所产生的细胞分布图谱非常一致。采用多组学细胞术，您还可以将每个细胞的基因表达、T/B细胞的TCR/Ig序列以及抗原特异性信息相叠加，从而准确地鉴定细胞身份、状态和功能。
您可以将寡核苷酸与目的抗体进行定制偶联，以便用于10x Genomics的流程。您可以选择BioLegend的定制偶联服务，也可以选择Abcam的定制偶联试剂盒，获得或创建与寡核苷酸偶联的定制抗体。
如果您有意富集特定的细胞群或稀有的细胞类型，您可以在10x Genomics文库制备之前分选细胞。在分选之前，采用寡核苷酸偶联抗体和流式抗体对细胞进行染色。
细胞表面蛋白的分析可单独开展，而无需进行基因表达或免疫分析。细胞在染色后被分液到GEM中，其中cDNA分子被加上条形码。使用所产生的cDNA来生成细胞表面蛋白文库。
10x Genomics提供了数据分析和可视化软件，包括Cell Ranger、Loupe Browser和Loupe V(D)J Browser。Cell Ranger是一套分析流程，能够根据每个细胞的基因和/或蛋白自动生成表达谱，并识别细胞簇。之后可使用我们交互式的可视化软件Loupe Browser和Loupe V(D)J Browser来观察和解释结果。
