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固定，批量处理，灵活运行
有了强大的固定方案，您可以按照自己的日程表运行分析，简化样本运输，优化工作流程。
分析新鲜、冷冻和固定样本
轻松分析以往无法进行实验的样本，从固定组织（甚至是FFPE样本）到细胞、细胞核以及流式分选后的细胞。
降低每个样本的成本
批量和混样分析可使得每个样本的成本降低多达75%，并降低测序成本，最大限度利用您的资源。
超高的实验灵活性
每次运行可处理多达100万个细胞，并能轻松调整批量和样本通量，同时捕获蛋白和基因表达信息。
行业领先的性能表现
即使是受损RNA或低表达基因的全转录组分析也具有超高的灵敏度，让您对数据充满信心。
简化的工作流程和数据分析
您可以通过轻松且可重复的实验方案、简化的数据管理和快速处理来探索基因表达谱。
您可以做什么
简化样本的物流运输，并设置自己的实验日程表
样本固定和储存可以实现优化且灵活的样本批量处理，同时减少可变性并保持数据质量。
从挑战性的样本中获得高质量的数据，即使是FFPE样本
创新的探针设计带来了灵敏而可靠的性能，即使是整块组织、FFPE样本以及带有片段化RNA的样本。
将经济高效的scRNA-seq推广到更多样本
降低每个样本的成本，扩大单细胞实验的范围，让更大规模的实验得以开展。
轻松开展多地实验
可靠的操作方案可保留珍贵样本的生物学特征，让全球范围内的研究成为可能。
捕获可满足您研究需求的数据
分析的灵活性让您可同时捕获蛋白和基因表达，或通过用户设计的探针对靶向特定RNA，对全转录组基因组合进行补充。
经过验证的结果
视频
资源
Robust results for scRNA-seq from matched FFPE and freshly fixed samples
Robust results for scRNA-seq from matched FFPE and freshly fixed samples
Data Spotlight
Data Spotlight
Isolation of Cells from FFPE Tissue Sections for Chromium Fixed RNA Profiling
Isolation of Cells from FFPE Tissue Sections for Chromium Fixed RNA Profiling
Demonstrated Protocol
Demonstrated Protocol
Single Cell Gene Expression Flex: Lock in cell states, unlock potential
Single Cell Gene Expression Flex: Lock in cell states, unlock potential
Blog
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完整的解决方案
Chromium单细胞基因表达Flex试剂盒
我们的试剂盒能够对人类或小鼠的新鲜、冷冻或固定样本进行单细胞全转录组分析，并同时测定细胞表面蛋白，从而探索细胞多样性。
工作流程
滚动查看单细胞基因表达Flex的基本流程。您还有更多选择，包括采用混样分析来提高通量，或在单样或混样流程中使用Feature Barcode技术来检测细胞表面蛋白。
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采集样本
从新鲜、冷冻或固定的细胞、细胞核或整块组织开始。对于新鲜样本，请按照样本制备的最佳做法进行操作，以便获得高质量的单细胞悬液（或跳到第2步进行组织固定）。如有必要，使用Feature Barcode技术对整个细胞进行标记，以便在分析基因表达的同时分析细胞表面蛋白。
对于FFPE样本，请按照我们的示范方案进行操作，以便获得如何解离FFPE组织用于此分析的指引。解离后的样本可在4°C安全保存一周，或在–80°C保存6个月。如果不需要保存解离后的样本，可直接跳到第3步。
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样本固定和透化
按照我们简单明了的方案用多聚甲醛（PFA）固定样本，同时锁定生物学状态并保留脆弱细胞。此时，样本可在-80℃进行安全运输或储存，直到您准备好处理这些样本为止。
如果您处理的是FFPE样本，请跳过这一部分，直接开始第3步。
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构建10x文库
将探针组与固定样本杂交，然后在Chromium iX或X仪器上进行单细胞微滴生成。经过连接和延伸反应，构建10x条形码文库。在每个纳升规模的分区反应体系内，细胞发生以RNA为模板的连接，因此每个由此生成的产物都共享一个来自其单个来源细胞的10x条形码。对于提高通量的混样流程，将您的样本与探针组杂交，把这些样本混合在一起，再照常进行操作——Chromium芯片的单个通道最多可分析16个样本。在这种情况下，附加在每组探针上的另一个独特条形码可帮助您将每个单独的分子分配回它来源的样本。
如果在样本固定前，采用Feature Barcode技术对整个细胞进行标记，以分析细胞表面蛋白，则蛋白表达文库会与基因表达文库同时生成。
资源 - 4
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数据分析和可视化
我们的Cell Ranger分析软件可生成每个细胞的基因表达谱，识别表达谱相似的细胞簇，并汇总来自多个样本的数据。我们的Loupe Browser可视化软件可协助您交互式地探索结果。
数据分析流程的输出内容
输出内容包括QC信息和文件，这些文件可使用Loupe Browser可视化软件或第三方R工具及Python工具轻松实现进一步分析。
资源
常见问题
它能够使用基于探针的方法对单个细胞的转录组（人或小鼠）进行全面分析。Feature Barcode技术的加入还能同时分析细胞表面蛋白的表达，帮助您从多个维度探索复杂生物学。此产品还支持混样分析，可提高实验的通量和效率。
一项直接比较研究的结果表明，单细胞基因表达Flex分析的灵敏度是单细胞3’基因表达分析的两倍。
样本固定可以保留细胞状态，消除使单细胞分析具有挑战性的时间限制。有了固定方案，珍贵或脆弱样本能够实现从采集点到研究中心（如中心实验室或服务商）的运输，以便进行样本处理。
固定还可以实现批量分析，简化工作流程，并降低可变性，从而提高效率。固定还能中和传染源，并且在正确验证此步骤后，可能不再需要在生物安全三级实验室（BSL-3）中处理样本。
人类和小鼠的样本都与此分析兼容。您可以从新鲜或冷冻的单细胞/单细胞核悬液或组织开始，按照我们的固定方案进行操作，也可以从FFPE组织开始，按照我们的示范方案进行操作，以便获得解离FFPE组织用于单细胞基因表达Flex分析的指引。
人类和小鼠的新鲜样本都与此分析兼容。在固定前，（利用Feature Barcode技术）用抗体-寡核苷酸偶联物标记整个细胞，能够在检测基因表达的同时分析细胞表面蛋白。
10x Genomics Cloud Analysis 可让您通过简单的 Web 界面处理单细胞基因表达数据，利用优化的可扩展基础架构快速获得结果。用户可以通过 Cloud Analysis 设置和运行 Cell Ranger 流程。Cell Ranger 是一组分析流程，可自动为每个细胞生成表达谱并识别具有相似表达谱的细胞簇。随后，可以使用 Loupe Browser 以交互方式探索结果。
